Para ilmuwan menemukan 'titik lemah' di seluruh varian utama SARS-CoV-2
Studi ini dipimpin oleh ilmuwan Indo-Kanada, Dr Sriram Subramaniam, di Universitas British Columbia Kanada, dan diterbitkan sebagai artikel peer-review di jurnal Nature Communications.
Gambar atas: Mikroskop cryo-elektron mengungkapkan bagaimana fragmen antibodi VH Ab6 (merah) menempel pada situs yang rentan pada protein lonjakan SARS-CoV-2 (abu-abu) untuk memblokir virus agar tidak mengikat reseptor sel ACE2 manusia (biru).
Para peneliti, yang dipimpin oleh seorang ilmuwan Indo-Kanada, mengatakan mereka telah menemukan kerentanan umum di seluruh varian utama Covid-19 SARS-CoV-2, termasuk subvarian Omicron yang lebih menular, menurut sebuah penelitian yang diterbitkan pada hari Kamis, menawarkan kemungkinan pengobatan antibodi yang ditargetkan.
Studi ini dilakukan oleh kolaborasi antara peneliti di University of British Columbia Kanada - yang dipimpin oleh Dr Sriram Subramaniam, seorang profesor di fakultas kedokteran - dan University of Pittsburgh, AS - yang dipimpin oleh Drs. Mitko Dimitrov dan Wei Li. Itu diterbitkan sebagai artikel peer-review di jurnal Nature Communications.
Studi ini menggunakan cryo-electron microscopy (cryo-EM) untuk mengungkap struktur tingkat atom dari titik rentan pada protein lonjakan virus, yang dikenal sebagai epitop. Teknologi pencitraan yang kuat ini menggunakan berkas elektron untuk memvisualisasikan bentuk jaringan dan sel menggunakan teknik ultra-pendinginan (“cryo”). Karena virus Covid-19 100.000 kali lebih kecil dari ukuran kepala peniti, virus ini tidak terdeteksi menggunakan mikroskop cahaya biasa.
Antibodi menempel pada virus dengan cara tertentu, "seperti kunci yang masuk ke gembok", menurut Subramaniam, yang menyelesaikan gelar MSc Kimia dari IIT-Kanpur. Namun, ketika virus bermutasi, kuncinya tidak lagi cocok.
“Kami telah mencari kunci utama – antibodi yang terus menetralisir virus bahkan setelah mutasi ekstensif,” tambahnya.
“'Kunci utama' yang diidentifikasi dalam makalah baru ini adalah fragmen antibodi VH Ab6, yang terbukti efektif melawan varian Alpha, Beta, Gamma, Delta, Kappa, Epsilon, dan Omicron. Fragmen itu menetralkan SARS-CoV-2 dengan menempelkan epitop pada protein lonjakan dan menghalangi virus memasuki sel manusia, ”jelas pernyataan dari University of British Columbia.
“Studi ini mengungkapkan titik lemah yang sebagian besar tidak berubah di seluruh varian dan dapat dinetralkan oleh fragmen antibodi. Ini menetapkan panggung untuk desain perawatan pan-variant yang berpotensi membantu banyak orang yang rentan, ”kata Subramaniam, yang juga penulis senior studi tersebut.
Dia mengatakan kerentanan utama ini sekarang dapat dieksploitasi oleh produsen obat, dan karena situs tersebut relatif bebas mutasi, perawatan yang dihasilkan bisa efektif terhadap varian yang ada—dan bahkan di masa depan—.
“Kami sekarang memiliki gambaran yang sangat jelas tentang titik rentan virus ini. Kita tahu setiap interaksi yang dibuat protein lonjakan dengan antibodi di situs ini. Kami dapat bekerja mundur dari ini, menggunakan desain cerdas, untuk mengembangkan banyak perawatan antibodi, ”katanya.
“Sekarang kami telah menjelaskan struktur situs ini secara rinci, ini membuka kemungkinan pengobatan yang sama sekali baru,” katanya.
Sumber: Scientists discover ‘weak spot’ across major SARS-CoV-2 variants
Studi ini dipimpin oleh ilmuwan Indo-Kanada, Dr Sriram Subramaniam, di Universitas British Columbia Kanada, dan diterbitkan sebagai artikel peer-review di jurnal Nature Communications.
Gambar atas: Mikroskop cryo-elektron mengungkapkan bagaimana fragmen antibodi VH Ab6 (merah) menempel pada situs yang rentan pada protein lonjakan SARS-CoV-2 (abu-abu) untuk memblokir virus agar tidak mengikat reseptor sel ACE2 manusia (biru).
Para peneliti, yang dipimpin oleh seorang ilmuwan Indo-Kanada, mengatakan mereka telah menemukan kerentanan umum di seluruh varian utama Covid-19 SARS-CoV-2, termasuk subvarian Omicron yang lebih menular, menurut sebuah penelitian yang diterbitkan pada hari Kamis, menawarkan kemungkinan pengobatan antibodi yang ditargetkan.
Studi ini dilakukan oleh kolaborasi antara peneliti di University of British Columbia Kanada - yang dipimpin oleh Dr Sriram Subramaniam, seorang profesor di fakultas kedokteran - dan University of Pittsburgh, AS - yang dipimpin oleh Drs. Mitko Dimitrov dan Wei Li. Itu diterbitkan sebagai artikel peer-review di jurnal Nature Communications.
Studi ini menggunakan cryo-electron microscopy (cryo-EM) untuk mengungkap struktur tingkat atom dari titik rentan pada protein lonjakan virus, yang dikenal sebagai epitop. Teknologi pencitraan yang kuat ini menggunakan berkas elektron untuk memvisualisasikan bentuk jaringan dan sel menggunakan teknik ultra-pendinginan (“cryo”). Karena virus Covid-19 100.000 kali lebih kecil dari ukuran kepala peniti, virus ini tidak terdeteksi menggunakan mikroskop cahaya biasa.
Antibodi menempel pada virus dengan cara tertentu, "seperti kunci yang masuk ke gembok", menurut Subramaniam, yang menyelesaikan gelar MSc Kimia dari IIT-Kanpur. Namun, ketika virus bermutasi, kuncinya tidak lagi cocok.
“Kami telah mencari kunci utama – antibodi yang terus menetralisir virus bahkan setelah mutasi ekstensif,” tambahnya.
“'Kunci utama' yang diidentifikasi dalam makalah baru ini adalah fragmen antibodi VH Ab6, yang terbukti efektif melawan varian Alpha, Beta, Gamma, Delta, Kappa, Epsilon, dan Omicron. Fragmen itu menetralkan SARS-CoV-2 dengan menempelkan epitop pada protein lonjakan dan menghalangi virus memasuki sel manusia, ”jelas pernyataan dari University of British Columbia.
“Studi ini mengungkapkan titik lemah yang sebagian besar tidak berubah di seluruh varian dan dapat dinetralkan oleh fragmen antibodi. Ini menetapkan panggung untuk desain perawatan pan-variant yang berpotensi membantu banyak orang yang rentan, ”kata Subramaniam, yang juga penulis senior studi tersebut.
Dia mengatakan kerentanan utama ini sekarang dapat dieksploitasi oleh produsen obat, dan karena situs tersebut relatif bebas mutasi, perawatan yang dihasilkan bisa efektif terhadap varian yang ada—dan bahkan di masa depan—.
“Kami sekarang memiliki gambaran yang sangat jelas tentang titik rentan virus ini. Kita tahu setiap interaksi yang dibuat protein lonjakan dengan antibodi di situs ini. Kami dapat bekerja mundur dari ini, menggunakan desain cerdas, untuk mengembangkan banyak perawatan antibodi, ”katanya.
“Sekarang kami telah menjelaskan struktur situs ini secara rinci, ini membuka kemungkinan pengobatan yang sama sekali baru,” katanya.
Sumber: Scientists discover ‘weak spot’ across major SARS-CoV-2 variants
Terakhir diedit oleh moderator:
